Laboratuvar 06.09.2007 /215 Sayılı Yönetim Kurulu Kararı ile bağımsız bir birim olarak tanımlanmıştır.
Laboratuvarda, uygun bir yönetim sistemi oluşturulmuş olup, uygulanmakta ve sürdürülmektedir. Laboratuvarda, deney sonuçlarının kalitesini güvenceye almak için gereken bütün politika, sistem, program, prosedür ve talimatlar doküman hâline getirilmiştir. Laboratuvar, deneylerinde uluslararası geçerli yöntemleri uygulaması, deney hizmetlerinin güvenilirliğinin sağlanması ve performansının arttırılması amaçlarına yönelik olarak, TS EN ISO/IEC 17025 standardına göre kurulmuş kalite sistemi ile çalışmaktadır.
Kalite Yönetim Sistemi; TS EN ISO/IEC 17025 standardı temel alınarak hazırlanır ve güncelliği sağlanır. Bu nedenle; Kalite Yönetim Sistemi, Laboratuvarda atık su analizleri ile ilgili gerçekleştirilen faaliyetlerini ve sahada gerçekleştirilen numune alma faaliyetlerini kapsamaktadır.